《女职工劳动保护特别规定》第八条 女职工产假期间的生育津贴,对已经参加生育保险的,按照用人单位上年度职工月平均工资的标准由生育保险基金支付;对未参加生育保险的,按照女职工产假前工资的标准由用人单位支付。女职工生育或者流产的医疗费用,按照生育保险规定的项目和标准,对已经参加生育保险的,由生育保险基金支付;对未参加生育保险的,由用人单位支付。
所以你所在的公司要承担的是该女职工生育时的医疗费用和产假期间的生育津贴。若员工提起劳动仲裁,公司未为员工购买社保属于违法行为,公司可能还要承担其他的一些法律责任。